20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0062 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_R0062  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0033  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0016  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0022  tRNA-Ala  95.83 
 
 
72 bp  119  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0059  tRNA-Ala  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0025  tRNA-Ala  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.326972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0002  tRNA-Ala  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.227888  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0030  tRNA-Ala  93.06 
 
 
72 bp  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00218257  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0002  tRNA-Ala  93.06 
 
 
72 bp  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00133313  normal  0.0937878 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0059  tRNA-Ala  93.06 
 
 
72 bp  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0016  tRNA-Ala  88.89 
 
 
72 bp  79.8  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  88.37 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177438  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_265  tRNA-Ala  88.37 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0031  tRNA-Thr  84.75 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0005  tRNA-Ala  88.37 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0056  tRNA-Ala  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0040  tRNA-Ala  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0022  tRNA-Ala  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0041  tRNA-Ala  90.48 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.239536  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0038  tRNA-Ala  90.48 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>