21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0012 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0012  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.147828 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0033  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0061  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.060287  hitchhiker  0.000000000381707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0002  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0026  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.789038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0067  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0071  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0034  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000924303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0042  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0039  tRNA-Ala  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.980011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0031  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0170329  normal  0.236609 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0019  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.189321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0055  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.882837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1917  tRNA-Ala  86 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0004  tRNA-Ala  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t40  tRNA-Ala  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>