297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR_t40 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR_t40  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1917  tRNA-Ala  100 
 
 		 78 bp  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0015  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  119  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.189321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4339  tRNA-Ala  97.01 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838936  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0046  tRNA-Ala  97.01 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0016  tRNA-Ala  97.01 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0034  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000924303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0038  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.559626  normal  0.321441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0060  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0051  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0870511  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0002  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0064  tRNA-Ala  98.15 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.805533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0011    96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0001  tRNA-Ala  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.272552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0002  tRNA-Ala  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0019  tRNA-Ala  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0012  tRNA-Ala  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0032  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0017  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0014  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0014  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.580851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0029  tRNA-Ala  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000441768  normal  0.0859577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0047  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00354694  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0048  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0035  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0037  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0040  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0007  tRNA-Ala  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA3  tRNA-Ala  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0062  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0061  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0057  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0004  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0066  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0003  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10591  normal  0.264536 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0022  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.734931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0046  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137197 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0048  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0038  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59206  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0057  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0041  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177438  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0054  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0021  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t02  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0460294  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19780  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0002  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32630  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.319038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0058  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000131227  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0049  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0039  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0063  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0054  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0056  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000109894  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_265  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0034  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.884899  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0068  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240621  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0005  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1441  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000019523  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0036  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0015  tRNA-Ala  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0002  tRNA-Ala  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0064  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0065  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0061  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3137t  tRNA-Ala  87.1 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00236079  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0057  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0054  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0003  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245807  unclonable  0.00000000000471702 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0038  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.644125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS02400  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0052  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0037  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0049  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.695027  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0058  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0023  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0014  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0040  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0006  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829579  hitchhiker  0.00518184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0001  tRNA-Ala  86.89 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0049  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0045  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0010  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0964882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0067  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.840487  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0029  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.978783  normal  0.786802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0055  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.105758  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0006  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0006  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0007  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.110552  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0006  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470986 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3896  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.998129  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0043  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0030  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546773  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0045  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0695113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>