More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_R0055 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_R0055  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.882837  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0029  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0034  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0019  tRNA-Ala  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0037  tRNA-Ala  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000878402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0054  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.755946  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0065  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0065  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0002  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0016  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0054  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0016  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000267693  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0035  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2157  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0010  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0704322  hitchhiker  0.00208971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5401  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0384247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60010  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0174711  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2321  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2238  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2231  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1274  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6151  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1510  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2257  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.124846  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0461  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.689398  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1464  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60350  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.094178  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60390  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60170  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000756055  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0053  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0050  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0108182  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0018  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0080  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00204855  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0072  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000523195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4844  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054319  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1523  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0033  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0813  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2188  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1712  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0456  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0384853  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0077  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.329264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08590  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55634  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.269014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62070  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70890  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.419729 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2178  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0036  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000936293  normal  0.188106 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1725  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.67576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0080  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0169  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60100  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0518  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0153  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0507  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0352051  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0040  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60560  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0012077  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1705  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0031  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0202697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0026  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0015  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000110801  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0076  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000601074  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0101  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00826965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t04  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA15  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140136  normal  0.0102335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA81  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00142149  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R3  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00599738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R43  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000550301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R58  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R79  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916269  hitchhiker  0.00756682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R92  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000124955  normal  0.753041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>