185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0016 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_R0016  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000587124  normal  0.11774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000535173  decreased coverage  0.000361063 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0038  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0019  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.399377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0011  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0003  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000742572  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309089  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309140  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309204  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72887  normal  0.842293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0024  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188635  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309163  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309372  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.272937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0004  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0020  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0002  tRNA-Ala  97.67 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0002  tRNA-Ala  97.67 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.22367  normal  0.0175054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0002  tRNA-Ala  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0002  tRNA-Ala  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353187  normal  0.0609648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0003  tRNA-Ala  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411773  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14002  tRNA-Ala  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0041  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00109755  normal  0.386448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0008  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0953331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0032  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.168105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0037  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0051  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0021  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000106448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0034  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000564918  normal  0.218531 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0049  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0008  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00866948  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309282  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127609 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309290  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0044  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0002  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0002  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0040  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000841644  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0027  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0020  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  94.59 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0025  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.877101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0605541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0010  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.451721  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0037  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00519956  normal  0.826758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0070  tRNA-Ala  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0186  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0008  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00250215  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1816  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0048  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0002  tRNA-Ala  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0047  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0058  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000000000613252  normal  0.244453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0019  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805643  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0022  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60497 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t21  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0058  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.000000000000357472  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000000354338  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0044  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2625  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2626  hypothetical protein  83.56 
 
 		 1470 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000164664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0066  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000021471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0018  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.392779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0075  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0041  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0029  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0993455  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1985  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000056627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0051  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.697724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0016  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0045  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000205649  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0050  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000169071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0044  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0043  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0476411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0092  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000000431101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0031  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214568  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0058  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000348439  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0056  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305477  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0028  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000000054137  normal  0.608945 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0018  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.867463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0040  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0564  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2101  hypothetical protein  83.56 
 
 		 228 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000210975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2102  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000104727  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0048  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0053  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3211  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000514426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4567  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.926524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2486  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314441  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2540  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0000814865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1375  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000019852  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0028  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000102756  hitchhiker  0.00235863 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1212  tRNA-Trp  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0018  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0036  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.868247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0023  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.20757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0040  tRNA-Val  85.94 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949801 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>