More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_R0075 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_R0075  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0035  tRNA-Lys  96.49 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0047  tRNA-Lys  96.49 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0011  tRNA-Asn  95 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00131891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0011  tRNA-Lys  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.983753  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0012  tRNA-Lys  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0014  tRNA-Lys  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA35  tRNA-Lys  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.056149  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0023  tRNA-Lys  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.051511  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0060  tRNA-Lys  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.845098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna43  tRNA-Lys  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0022  tRNA-Lys  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195324  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0060  tRNA-Lys  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0052  tRNA-Lys  96.08 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0015  tRNA-Lys  94.55 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0071  tRNA-Lys  96.08 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4239  tRNA-Lys  96.08 
 
 
78 bp  85.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00412423  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0045  tRNA-Lys  96.08 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2046  tRNA-Lys  96.08 
 
 
78 bp  85.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000370287  hitchhiker  0.00336958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0040  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0039  tRNA-Lys  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0040  tRNA-Lys  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0074  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900217  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0009  tRNA-Lys  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.420581  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0027  tRNA-Lys  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00574952  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0046  tRNA-Lys  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.856653  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0079  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0001  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0034  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108602  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0077  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.435861  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000148305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00020  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000893076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0031  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0816  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000928863  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0771  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162037  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00251  tRNA-Lys  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2557  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000373976  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0772  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175235  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00376  tRNA-Lys  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0910  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000110195  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4657  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.396889999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4655  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  8.59319e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0068  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000208772  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0067  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000904848  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3081t  tRNA-Lys  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000675432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2783  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.45376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0766  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000107183  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2562  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000496401  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0847  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000390695  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0882  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000105642  normal  0.563094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0914  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00299475  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2653  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000100151  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0016  tRNA-Lys  88.89 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0069  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000622929  normal  0.276829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0790  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000513232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0666  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0814  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000653999  normal  0.868526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0817  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000862266  normal  0.885127 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0667  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0583  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.0474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2783  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000664691  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3087t  tRNA-Lys  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00291749  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0458  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0819  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  normal  0.860753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0818  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0005423  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0880  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000131793  normal  0.645347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0787  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000114753  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4660  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.11514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4659  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.951839999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5020  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5022  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000229653  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4684  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.3682299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5024  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0073  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623521  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715976  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0036  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000584737  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0912  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000796391  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0913  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000921732  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4247  tRNA-Lys  94.23 
 
 
71 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000042551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0878  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000133144  normal  0.655098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2611  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000669523  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06830  tRNA-Lys  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4248  tRNA-Lys  94.23 
 
 
71 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000404741  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2677  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000682984  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0850  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000232917  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0849  tRNA-Lys  92.86 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000240057  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0036  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000225732  normal  0.109866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0038  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000184687  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0039  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375421  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0040  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351036  normal  0.107458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0064  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000662129  normal  0.0840838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>