More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0004 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309204  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72887  normal  0.842293 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309140  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309372  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.272937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309163  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.399377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309089  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0020  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309290  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309282  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0008  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00866948  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0008  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0953331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0032  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.168105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0037  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0051  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0021  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000106448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0034  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000564918  normal  0.218531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0041  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00109755  normal  0.386448 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0040  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000841644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0020  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0002  tRNA-Ala  98.15 
 
 		 73 bp  99.6  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0001  tRNA-Ala  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0032  tRNA-Ala  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0018  tRNA-Ala  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0308139  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0049  tRNA-Ala  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0004  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.892843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0041  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0018  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0605541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0027  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.877101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0037  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00519956  normal  0.826758 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0041  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.239536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0016  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000587124  normal  0.11774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0027  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000535173  decreased coverage  0.000361063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0038  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0010  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.407573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0025  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0005  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0005  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0010  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057492  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0046  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0258027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0051  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00326143  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0008  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000809396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0072  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000540506  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0010  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.451721  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0186  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0063  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.808449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t04  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0002  tRNA-Ala  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0033  tRNA-Val  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000215711  hitchhiker  0.00721353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0058  tRNA-Val  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.703111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0017  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161415  hitchhiker  0.00407434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0103  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000241452  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0128  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000050642  normal  0.0403899 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0020  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0048  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.544704  hitchhiker  0.00053111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0056  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0061  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0084  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0403496  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0021  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.984556  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0050  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0058  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0063  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0487  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.112524  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla01  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla02  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0627  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351596  normal  0.0173581 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0469  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000319828  normal  0.0257822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0004  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000571046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0060  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000375554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0047  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000145993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4205  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4292  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000724507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4264  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000257856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0041  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0080  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00204855  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0072  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000523195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0030  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0036  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000936293  normal  0.188106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0010  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0704322  hitchhiker  0.00208971 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2238  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2231  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0034  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0065  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0016  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000267693  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1705  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0054  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.755946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0016  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390105  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0029  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0013  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0036  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2157  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0456  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0384853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>