25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0033 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0033  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.357383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0020  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.420795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0042  tRNA-Ala  87.1 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1590  tRNA-Val  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0985046  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0019  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0513  tRNA-Val  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309523  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0510  tRNA-Val  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.228812  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2260  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.177016  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2218  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2183  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2179  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1161  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0179935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1157  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00434161  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1739  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000050357  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1735  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000539085  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0602  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.375399  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0598  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Val-2  tRNA-Val  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.57043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0605022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>