200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0513 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.57043  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0510  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.228812  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1161  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0179935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1157  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00434161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1735  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000539085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1739  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000050357  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0513  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2260  tRNA-Val  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.177016  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2218  tRNA-Val  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0019  tRNA-Val  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0598  tRNA-Val  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0602  tRNA-Val  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.375399  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2183  tRNA-Val  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2179  tRNA-Val  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1590  tRNA-Val  95.89 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0985046  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0037  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00204676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0039  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00777868  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0058  tRNA-Val  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.703111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0033  tRNA-Val  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000215711  hitchhiker  0.00721353 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0002  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0002  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02886  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.96324  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2359  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.752155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0016  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0267125  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1639  tRNA-Val  94.44 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.42917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2476  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0044  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0043  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000280883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2123  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0036  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000106131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0039  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.654664  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0506  tRNA-Val  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000210489  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0032  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0382858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0003  tRNA-Val  90.38 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1228  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2318  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0283125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0022  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0042  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0017  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0037  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599971  normal  0.116724 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1953  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0015  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0394069 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0022  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3351  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0607256  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0001  tRNA-Val  93.02 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0040  tRNA-Val  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0013  tRNA-Val  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.459697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0029  tRNA-Val  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000448285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0032  tRNA-Val  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.69442e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0027  tRNA-Val  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00584836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0037  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00519956  normal  0.826758 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0018  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0605541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0013  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0036  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0037  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0014  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0014  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0037  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0027  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.877101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0041  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0030  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0104  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000459096  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0096  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000340582  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t075  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t077  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0033  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.166955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0058  tRNA-Val  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0001  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0032  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0018  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0308139  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0049  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0105  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000937132  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0088  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000319875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0089  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000342234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0090  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0091  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0092  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0093  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0021  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0415147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0100  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0036  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429203  normal  0.313017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0107  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000125343  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0057  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00234927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0058  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00230233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0059  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00221278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0106  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000011333  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0061  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0061  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000062426  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0098  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0099  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0100  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000389381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0097  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000319482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0095  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000338058  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0049  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.443386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0084  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000842373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0085  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000375389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0086  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000172065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>