42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_R0009 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0011  tRNA-Thr  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000646692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0046  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0058  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 99 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  100 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0046  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.262416  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0079  tRNA-OTHER  100 
 
 		 121 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  100 
 
 		 119 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0036  tRNA-Met  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0020  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.868603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0030  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 104 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0030  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0047  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.361519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0052  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.294271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0008  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0245883  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01590  tRNA-Cys  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.559741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0050  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0595881  unclonable  6.505860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01580  tRNA-Cys  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>