30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0079 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0079  tRNA-OTHER  100 
 
 		 121 bp  240  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000712114  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 99 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  100 
 
 		 101 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  100 
 
 		 119 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01580  tRNA-Cys  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0817304 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01590  tRNA-Cys  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 104 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0764  flagellar filament cap protein FliD  100 
 
 		 2301 bp  44.1  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00910953  normal  0.118857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>