64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0006 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0004  tRNA-Ser  90.74 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.303536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26140  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0078  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0042  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.810595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60250  tRNA-Ser  87.69 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0043  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6023  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0043  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0027  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0001  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0046  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0046  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.262416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0003  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0029  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.559741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  88.14 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0058  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481148  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_513  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0023  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0059  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.98639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0020  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0070  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.785527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0026  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0008  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.59905e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4306  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.025626  hitchhiker  0.00000743472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.226998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0019  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.248772  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309109  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.701033  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309077  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0001521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0012  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0056  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000000361768  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309348  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366383 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309153  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0047  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.232524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0021  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.443541  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0562701  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000210278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>