17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0052 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.294271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0011  tRNA-Thr  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0051  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0030  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0033  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0020  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  NMAR_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 124 bp  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.114787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0020  tRNA-OTHER  100 
 
 		 104 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00540287 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0009  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>