99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_R0041 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747779  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0026  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.234084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0047  tRNA-Met  94.2 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675982  normal  0.0740493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0026  tRNA-Met  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0039  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0041  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0236723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0007  tRNA-Met  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06700  tRNA-Met  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16830  tRNA-Met  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0022  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0041  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  87.14 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  87.14 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0028  tRNA-Met  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0022  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  87.14 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0022  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0039  tRNA-Met  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067349  normal  0.10104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t30  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00107522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  87.1 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0016  tRNA-Met  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00509711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0032  tRNA-Met  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366508  normal  0.496339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  87.14 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11950  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0612113  normal  0.0857463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-1  tRNA-Met  89.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0495998  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14040  tRNA-Met  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0671  tRNA-Met  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131694  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0011  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0028  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00106807  normal  0.150294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2777  tRNA-Met  85.71 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379753  normal  0.476878 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0002  tRNA-Met  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.452925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0021  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3898  tRNA-Met  85.71 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0033  tRNA-Met  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.311584 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0668  tRNA-Met  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1863  tRNA-Met  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000158589  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3515  tRNA-Met  85.71 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  85.96 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  85.96 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0615  tRNA-Met  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.294067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0049  tRNA-Met  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0021032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0023  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.013256 
 
 
-
 
NC_006368  lppt33  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt33  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0023  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00191996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0025  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132615  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0006  tRNA-Met  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0011  tRNA-Met  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0021  tRNA-Met  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.715825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0039  tRNA-Met  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474012  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0041  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0033  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0055  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0012  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0032  tRNA-Met  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169141  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0036  tRNA-Met  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0053  tRNA-Lys  87.04 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000949911  hitchhiker  0.00166028 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0078  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376289  normal  0.616064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16710  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.879903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>