72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0066 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0066  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0033  tRNA-Met  97.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0035  tRNA-Met  97.67 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_364  tRNA-Met  97.62 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0082247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0008  tRNA-Met  97.62 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0448209  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0001  tRNA-Met  95.65 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.699138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-1  tRNA-Met  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000665936  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0001  tRNA-Met  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213191 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0036  tRNA-Met  94 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.572801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  93.88 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0032  tRNA-Met  92.31 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.094935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0003  tRNA-Met  92.31 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0024  tRNA-Met  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0021  tRNA-Met  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114234  normal  0.0173767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0024  tRNA-Met  97.22 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  90.2 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  93.02 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  90.2 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  90.2 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  93.02 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  90.2 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0013  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06700  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0041  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0236723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0039  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0047  tRNA-Asn  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0440889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0033  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.311584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0022  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09430  tRNA-Met  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.588566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0032  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366508  normal  0.496339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2777  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379753  normal  0.476878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000793329  hitchhiker  0.000000622773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0079  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0501725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0072  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0615  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.294067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0019  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3515  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  100 
 
 		 1815 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4329  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.217954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0042  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0043  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0503955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0026  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>