36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_R0007 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_R0007  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0079  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0059  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00316433  unclonable  0.00000584596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0053  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0004  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0061  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0050  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1159  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00817657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0020  tRNA-Lys  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000503685  hitchhiker  0.000000175517 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0515  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.317798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0512  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.299148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0509  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226586  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0049  tRNA-Lys  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1162  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0178248  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.590249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1740  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000195232  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1737  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000166556  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309209  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0012  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0409907  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0042  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000110387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0043  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0044  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000117241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0061  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0060  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00703391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0012  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0038  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0017  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00877292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>