More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_R0020 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0036  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.415695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0035  tRNA-Lys  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0989882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0021  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0035  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0036  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0360191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0037  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00809358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0038  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0168892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0039  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0153762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0015  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04831  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0006  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0048  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.780393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0045  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000363633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26570  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000438766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0036  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0043  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0023  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0320395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0010  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2736  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000214586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4252  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000173353  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0065  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0063  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1400  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4226  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4250  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179224  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0080  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0062  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012796  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0064  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4253  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.87819e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4251  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000189937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0049  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000590411  decreased coverage  0.00000280751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0018  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0039  tRNA-Lys  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0004  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4247  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000042551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0048  tRNA-Lys  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4248  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000404741  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0052  tRNA-Lys  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0125474  normal  0.521924 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000148305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4659  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.951839999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0036  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000584737  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5024  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4661  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2046  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000370287  hitchhiker  0.00336958 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0071  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5023  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0067  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000904848  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  97.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0064  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000662129  normal  0.0840838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0048  tRNA-Asn  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.645355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0038  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000184687  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0051  tRNA-Lys  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.022056 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4655  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  8.59319e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4657  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.396889999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0521  tRNA-Lys  97.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>