More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_R0039 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_R0035  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0036  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0360191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0037  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00809358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0038  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0168892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0039  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0153762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1734  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1735  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1736  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1737  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1738  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.847044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1739  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.829671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0072  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18023  normal  0.42489 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0060  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000123741  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0059  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000522849  normal  0.720074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0062  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112705  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0057  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000607595  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0058  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000626368  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0064  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000484105  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0061  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000126169  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0009  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.66226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0036  tRNA-Lys  97.78 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.415695  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00015  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000191141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000148305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00020  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000893076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0031  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0056  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000193092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0768  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000959618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0038  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000184687  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0063  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807703  normal  0.539027 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4661  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0060  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0772  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0766  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000107183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0583  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.0474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0004  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0035  tRNA-Lys  97.73 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0989882  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0020  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.255497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0036  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000225732  normal  0.109866 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4659  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.951839999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0817  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000862266  normal  0.885127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0064  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000662129  normal  0.0840838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5024  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5020  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0065  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000203658  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0067  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000904848  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0771  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0060  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.845098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2557  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000373976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0069  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000622929  normal  0.276829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0667  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna28  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.751931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2783  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.45376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0666  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0022  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0816  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000928863  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0814  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000653999  normal  0.868526 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna43  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0054  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0055  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000306269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0056  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000278009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0057  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000124727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0058  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000115493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0059  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000128133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0040  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351036  normal  0.107458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2611  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000669523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0819  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  normal  0.860753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0818  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0005423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4657  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.396889999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4684  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.3682299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4660  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.11514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4655  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  8.59319e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0039  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375421  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0056  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000735522  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5023  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5022  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000229653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0037  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000000657367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0038  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0068  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000208772  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0036  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000584737  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0073  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623521  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0071  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577417  normal  0.268649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>