More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0002 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0002  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0025  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.469225  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0030  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0019  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0073  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0013  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671128  normal  0.694866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0084  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0023  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483776  normal  0.0816799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0039  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219334  normal  0.700265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0006  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0028  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0521  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0065  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.448477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t13  tRNA-Lys  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000197803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t15  tRNA-Lys  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00592778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t23  tRNA-Lys  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t13  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t52  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.412315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA11  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00000000654973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA23  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5178  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R72  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564318  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R83  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115902  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0023  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000728017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0024  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000367183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0025  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000379634  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4531  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60080  tRNA-Lys  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.662949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60410  tRNA-Lys  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51660  tRNA-Lys  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.69309e-16  hitchhiker  0.000488803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60150  tRNA-Lys  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526914  hitchhiker  0.0000000110611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0037  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000000657367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0038  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0056  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000735522  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0063  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807703  normal  0.539027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0065  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000203658  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0033  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0054  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0055  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000306269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0056  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000278009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0057  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000124727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0058  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000115493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0059  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000128133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0030  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000178627  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0056  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000234634  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0052  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421031  normal  0.358949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0039  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000604757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0034  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0037  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000625887  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0033  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000129521  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t057  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t058  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t059  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t061  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t062  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0055  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000238115  normal  0.540083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0035  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000579305  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0050  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0053  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000170712  normal  0.532775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0051  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000189133  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0032  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000114848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0049  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000179433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0050  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000934403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0051  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000803834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0052  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0053  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0054  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0031  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000137565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0054  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000247004  normal  0.542082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0107  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000698154  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0038  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000589409  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0104  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000434862  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0105  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121754  normal  0.0191559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0106  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745947  normal  0.0185833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0107  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000134786  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0108  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0109  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000013008  normal  0.0178475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0110  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000621633  normal  0.0176654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0079  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0080  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000136157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0081  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0082  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0083  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000154707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0084  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0085  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>