More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_R0031 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_R0031  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000781489  hitchhiker  0.000000692381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0030  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000864029  hitchhiker  0.00000418087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0027  tRNA-Asn  95.77 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000466235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0041  tRNA-Asn  95.77 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000273116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0028  tRNA-Asn  95.77 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0043  tRNA-Asn  95.77 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00393457  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0039  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000227587  normal  0.0269838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0029  tRNA-Asn  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25599  normal  0.694984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0072  tRNA-Asn  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0073  tRNA-Asn  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0074  tRNA-Asn  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0031  tRNA-Asn  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0023  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2889  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000182855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2890  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000200194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2891  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000194238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2892  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000182855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0020  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0008  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0029  tRNA-Asn  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0902412  normal  0.0228096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0030  tRNA-Asn  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0034  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000816877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2815  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000000687096  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1828  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04000  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000234259  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0015  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000090416  normal  0.096467 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000000733307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0034  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000927259  normal  0.865314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0034  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225096  normal  0.395781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0036  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0058  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0204591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0039  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000683779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0067  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2933  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2934  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000107091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0039  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0033  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1694  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1695  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000039183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1827  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2876  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00000608308  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0012  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00139972  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2505  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000358439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2504  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000220613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2778  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136224  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0041  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.0000000000000766368  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0017  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000497879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0018  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000000318687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2777  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132175  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0044  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.975167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0053  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146858  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0033  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561489  normal  0.861574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0033  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0034  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000129233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0033  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224831  normal  0.39291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0052  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000077031  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0031  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000000420525  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0032  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000000399959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2877  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000083016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2816  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000213443  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0039  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.480095  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0040  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0049  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0041  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0042  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0041  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000136051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0058  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161243  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0059  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000863176  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0040  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345644  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0040  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000158111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0031  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07689  tRNA-Phe  94.12 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.754049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0031  tRNA-Asn  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0028  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546995  normal  0.0230083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0022  tRNA-Phe  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0077  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0079  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000505976  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0031  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R31  tRNA-Asn  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0050  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0049  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.666985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0048  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.645355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0047  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479856  normal  0.63722 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna118  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000544354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0007  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02962  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0034  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000955426  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0113  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA9  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000000314512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>