45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0014 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0014  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0079807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0009  tRNA-Lys  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALysVIMSS1309373  tRNA-Lys  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.589902  normal  0.683475 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALysVIMSS1309193  tRNA-Lys  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.238079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0009  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0475152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0025  tRNA-Lys  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.810895  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0113  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000284792  normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0088  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0047  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000357369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0116  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000104257  normal  0.0490719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0116  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399679  normal  0.0138295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0102  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831784  decreased coverage  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0039  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247045  normal  0.262143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0040  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0063  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60210  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0061  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000697471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0143  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000714151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0047  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000053333  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.629466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0041  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0106412  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000133182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t50  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294768  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R55  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41340  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.383585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3506  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0026  hypothetical protein  94.29 
 
 		 324 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000553875  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0059  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0013  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALysVIMSS1309168  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148138  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALysVIMSS1309127  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALysVIMSS1309093  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0029  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.403719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0036  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0004  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0038  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0018  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>