18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_R0013 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  87.32 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0061  tRNA-Thr  85.51 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000697471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0049  tRNA-Thr  96.77 
 
 
75 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528142  normal  0.775121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0048  tRNA-Thr  96.77 
 
 
75 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0052  tRNA-Thr  96.77 
 
 
75 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0054  tRNA-Thr  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.637165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0062  tRNA-Thr  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0009  tRNA-Thr  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0475152  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0036  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0012  tRNA-Thr  84.72 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0033  tRNA-Thr  88.24 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.9458700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0014  tRNA-Lys  91.18 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0079807 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0031  tRNA-Thr  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>