15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0007 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.9458700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0399  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000357697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0052  tRNA-Thr  96.55 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2373  tRNA-Thr  90.24 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0049  tRNA-Thr  96.55 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528142  normal  0.775121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0054  tRNA-Thr  96.55 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.637165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0048  tRNA-Thr  96.55 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0044  tRNA-Thr  93.94 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0369335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0088  tRNA-Thr  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0055  tRNA-Thr  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000011398  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  89.74 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  89.74 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0039  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.163516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>