19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_R0054 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_R0054  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0052  tRNA-Thr  97.3 
 
 		 75 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0049  tRNA-Thr  97.3 
 
 		 75 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528142  normal  0.775121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0048  tRNA-Thr  97.3 
 
 		 75 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0036  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0006  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0049  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0013  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0007  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.9458700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309283  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309083  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339408  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309158  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0046  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.22296 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0034  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>