33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_R0049 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0034  tRNA-Thr  94 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195631  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309158  tRNA-Thr  92 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309283  tRNA-Thr  92 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309083  tRNA-Thr  92 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0018  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0036  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0019  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216458  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309114  tRNA-Thr  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0028  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309180  tRNA-Thr  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.107667  normal  0.373641 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0035  tRNA-Thr  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4304  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300189  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0015  tRNA-Thr  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.870912 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0008  tRNA-Thr  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0049  tRNA-Thr  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528142  normal  0.775121 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0048  tRNA-Thr  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0052  tRNA-Thr  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0025  tRNA-Thr  97.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0169  tRNA-Thr  97.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0013  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261851  hitchhiker  0.00494296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA25  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309356  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.331876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0028  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0054  tRNA-Thr  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  88.31 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1226  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.186423  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0034  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2731  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.264397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2417  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000618371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0062  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.588176  normal  0.0646028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>