23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_R0035 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0008  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309114  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309180  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.107667  normal  0.373641 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309356  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.331876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309083  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339408  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309158  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0034  tRNA-Thr  95.77 
 
 		 72 bp  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195631  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0015  tRNA-Thr  95.77 
 
 		 72 bp  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.870912 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309283  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA25  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0028  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0042  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158394  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0049  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0015  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.728322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0028  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4304  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300189  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0031  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0180347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0035  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189489  normal  0.0273224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0013  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261851  hitchhiker  0.00494296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0036  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.212017  normal  0.456319 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R08  tRNA-Asn  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0036  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154889  normal  0.245058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>