184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R08 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_R08  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  90.74 
 
 
155 bp  67.9  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  91.67 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  91.67 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  91.67 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  91.67 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  91.67 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  91.67 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  91.67 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4299  tRNA-Asn  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0018  tRNA-Asn  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224402  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0028  tRNA-Asn  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227518  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6038  tRNA-Asn  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000594197  hitchhiker  0.00000000000000771476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0026  tRNA-Asn  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0032  tRNA-Asn  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0046  tRNA-Asn  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0045  tRNA-Lys  87.72 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0427355  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0742  tRNA-Asn  89.58 
 
 
72 bp  56  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00204496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  97.14 
 
 
76 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00351824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60080  tRNA-Lys  90 
 
 
73 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.662949  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0014  tRNA-Asn  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.566187  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0008  tRNA-Asn  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51660  tRNA-Lys  90 
 
 
73 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.69309e-16  hitchhiker  0.000488803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60150  tRNA-Lys  90 
 
 
73 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526914  hitchhiker  0.0000000110611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60410  tRNA-Lys  90 
 
 
73 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5178  tRNA-Lys  90 
 
 
78 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4531  tRNA-Lys  90 
 
 
78 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.76 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  87.76 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2267  tRNA-Asn  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0500335  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1454  tRNA-Asn  87.76 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2221  tRNA-Asn  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1414  tRNA-Asn  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.906421  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  87.76 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0763  tRNA-Asn  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.366453  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  87.76 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.513289  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0025  tRNA-Asn  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.728693  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4329  tRNA-Lys  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  93.75 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  93.75 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  93.75 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0042  tRNA-Lys  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0043  tRNA-Lys  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0503955 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t056  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t057  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t059  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t061  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t062  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0049  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000179433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0050  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000934403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0051  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000803834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0052  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0053  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0054  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0111  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.144334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0112  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.144334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0107  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00061714  normal  0.366999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0108  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.368852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0109  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  normal  0.372291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0110  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000275049  normal  0.380148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0111  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000310231  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0113  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000217944  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0104  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000434862  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0105  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121754  normal  0.0191559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0106  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745947  normal  0.0185833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0107  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000134786  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0108  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0109  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000013008  normal  0.0178475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0110  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000621633  normal  0.0176654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0042  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000170718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0079  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000144555  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0080  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000136157  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0081  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000158671  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0035  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000579305  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0038  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000589409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0039  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000604757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0050  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0051  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000189133  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0053  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000170712  normal  0.532775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0054  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000247004  normal  0.542082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0055  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000238115  normal  0.540083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0056  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000234634  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0030  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000178627  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0031  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000137565  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0034  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0035  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000175048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>