258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0081 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0053  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0280094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  90.14 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  90.14 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0042  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0057  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000258126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0084  tRNA-Asn  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000101082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  88.89 
 
 
72 bp  79.8  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  88.73 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  88.73 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0017  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0070  tRNA-Asn  88.16 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.213378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0021  tRNA-Asn  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0043  tRNA-Asn  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  92.16 
 
 
155 bp  69.9  0.00000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  95.35 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0019  tRNA-Asn  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0007  tRNA-Asn  87.14 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0026  hypothetical protein  89.23 
 
 
324 bp  65.9  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000553875  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  89.23 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000133182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  86.96 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  89.47 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  89.47 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  89.47 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  86.96 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  88.41 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0021  tRNA-Asn  86.76 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.552016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0011  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00974618  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  86.76 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0016  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000166672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0056  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  86.76 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  86.76 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0017  tRNA-Asn  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0033  tRNA-Asn  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102741  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  93.02 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0018  tRNA-Lys  97.06 
 
 
72 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0038  tRNA-Lys  97.06 
 
 
72 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0031  tRNA-Asn  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.61738  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALysVIMSS1309168  tRNA-Lys  97.06 
 
 
72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148138  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALysVIMSS1309093  tRNA-Lys  97.06 
 
 
72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALysVIMSS1309127  tRNA-Lys  97.06 
 
 
72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  87.72 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0074  tRNA-Met  87.72 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565222  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0049  tRNA-Asn  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0050  tRNA-Asn  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000354715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0051  tRNA-Asn  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000442391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0067  tRNA-Asn  86.11 
 
 
76 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143044  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0005  tRNA-Asn  84.72 
 
 
72 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0052  tRNA-Asn  84.72 
 
 
72 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0003  tRNA-Asn  84.72 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.173284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0043  tRNA-Asn  86.11 
 
 
76 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.362716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0067  tRNA-Asn  86.11 
 
 
76 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0056  tRNA-Asn  86.11 
 
 
76 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.880886  decreased coverage  0.00985409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  85.29 
 
 
75 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAsnVIMSS1309178  tRNA-Asn  84.72 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0075  tRNA-Asn  86.11 
 
 
76 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAsnVIMSS1309105  tRNA-Asn  84.72 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.512806  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAsnVIMSS1309137  tRNA-Asn  84.72 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.898434  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAsnVIMSS1309287  tRNA-Asn  84.72 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0002  tRNA-Asn  85.92 
 
 
76 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409498 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.27 
 
 
75 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  86.44 
 
 
76 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0076  tRNA-Asn  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509004  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>