94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0763 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1414  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.906421  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0763  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.366453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1454  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2267  tRNA-Asn  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0500335  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2221  tRNA-Asn  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0008  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0027  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000000619703  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0028  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000184427  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0206  hypothetical protein  100 
 
 		 135 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00645597  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0022  tRNA-Asn  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.275054  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_714  tRNA-Asn  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0692708  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0043  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0005  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0052  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  88 
 
 		 155 bp  52  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAsnVIMSS1309287  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0742  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00204496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R08  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0044  tRNA-Asn  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0403004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0043  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0044  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000117241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0042  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000110387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0015  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0605809  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.513289  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0026  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000338371  normal  0.10818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0061  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0060  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00703391  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0045  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000031214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0007  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000363973  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0013  tRNA-Asn  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0056  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0007  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0003  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.173284  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAsnVIMSS1309105  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.512806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAsnVIMSS1309137  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.898434  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0047  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0672814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAsnVIMSS1309178  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0005  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0052  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0046  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0047  tRNA-Asn  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0440889 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0052  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280732  normal  0.142339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>