18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_tRNAThrVIMSS1309356 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309356  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.331876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0035  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0008  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309114  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309180  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.107667  normal  0.373641 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309083  tRNA-Thr  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339408  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309158  tRNA-Thr  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0015  tRNA-Thr  97.18 
 
 		 72 bp  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.870912 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309283  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0034  tRNA-Thr  94.37 
 
 		 72 bp  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA25  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0042  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158394  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0028  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0049  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0015  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.728322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0028  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R08  tRNA-Asn  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4304  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>