213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_R0014 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.629466 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0029  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.23403e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0057  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.700226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0024  tRNA-Val  94.55 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.415553  normal  0.401158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0031  tRNA-Val  97.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.057517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0041  tRNA-Val  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.424139  normal  0.210105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  97.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  97.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0046  tRNA-Val  97.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  97.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0021  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0625627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1184  tRNA-Val  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0016  tRNA-Val  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000321371  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0780  tRNA-Val  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0068  tRNA-Val  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.064456  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0062  tRNA-Val  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309382  tRNA-Val  97.22 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.658487  normal  0.0584078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0051  tRNA-Val  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000163002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0044  tRNA-Val  95 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11940  tRNA-Val  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000016484  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0025  tRNA-Val  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368107  normal  0.0217616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309269  tRNA-Val  97.22 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0036  tRNA-Val  97.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0052  tRNA-Thr  87.3 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0014  tRNA-Val  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0005  tRNA-Thr  87.3 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0010  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.194881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0023  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.885733 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309100  tRNA-Val  97.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309173  tRNA-Val  97.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.124324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA51  tRNA-Thr  87.3 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0701295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0046  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0052    92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0017  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0020  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0056  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2208  tRNA-Val  93.48 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0049  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0046  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2130  tRNA-Val  93.48 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA13  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00601929  normal  0.184013 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0028  tRNA-Val  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.278514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0027  tRNA-Val  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0757548  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-1  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0049359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t039  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t040  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt39  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt39  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t069  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122297  hitchhiker  0.00465561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0021  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0144657  normal  0.36354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0051  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.223947  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0064  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00446845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0061  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0062  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.202264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0046  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0468144  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0074  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00199895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0063  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00384271  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2615  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.71269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0040  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00410606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0089  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000402356  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0090  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000384332  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0100  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395733  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0101  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.003873  normal  0.249554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0085  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0569302  hitchhiker  0.00000332622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0086  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236197  normal  0.0136376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0087  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0045  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0067  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.325907  normal  0.0460929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0073  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t068  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0011202  hitchhiker  0.00473676 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0042  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288324  hitchhiker  0.00194275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0042  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00634518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0043  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0061  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0062  tRNA-Val  91.49 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0040  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0007  tRNA-Val  93.18 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00275012  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Val-3  tRNA-Val  94.87 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0084  tRNA-Val  91.3 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0193203  normal  0.0545316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0015  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2091  tRNA-Val  94.87 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.872247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0079  tRNA-Val  91.3 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0663805  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0068  tRNA-Val  91.3 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0104216  hitchhiker  0.000843897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0047  tRNA-Val  91.3 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0087743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0073  tRNA-Val  93.62 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0074  tRNA-Val  93.62 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.593802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0109  tRNA-Val  91.3 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0081  tRNA-Val  91.3 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183039  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1767  tRNA-Val  94.87 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0016  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>