253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_2091 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Val-3  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2091  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.872247  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1767  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1570  tRNA-Val  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.736418  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2208  tRNA-Val  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2130  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0023  tRNA-Val  92.06 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.885733 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0007  tRNA-Val  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00275012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0073  tRNA-Val  90.77 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0074  tRNA-Val  90.77 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.593802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0066  tRNA-Val  90.77 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.603715  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0032  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000020219  hitchhiker  8.04575e-18 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0054  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0042  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05795  tRNA-OTHER  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0022  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.766553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0029  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0020  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.649475  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0010  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0021  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0026  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.211344  normal  0.0167997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0017  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00286264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0045  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00877282  normal  0.995576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0043  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0049  tRNA-Val  90.48 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00100813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0047  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.877588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0025  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0010  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00245461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0033  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0076  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0032  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100652  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0050  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0857362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0015  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000941457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0080  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217837  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0041  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0016  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0039  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0358134  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0042  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.921175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0054  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0041  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0045  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0010  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.194881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0029  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804432  normal  0.0419406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0026  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0073  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t039  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t040  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0061  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0064  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00446845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t069  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122297  hitchhiker  0.00465561 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0062  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0061  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0062  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.202264  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0063  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00384271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0089  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000402356  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0090  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000384332  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0100  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395733  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0101  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.003873  normal  0.249554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0074  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00199895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0085  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0569302  hitchhiker  0.00000332622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0086  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236197  normal  0.0136376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0087  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t068  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0011202  hitchhiker  0.00473676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0067  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.325907  normal  0.0460929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0042  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00634518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0043  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131984  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t34  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0987104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t35  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0521138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA41  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA42  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191671  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R39  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0141809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0045  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.431879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0027  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.543066  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0034  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0088  tRNA-Val  87.88 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.109488  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0066  tRNA-Val  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00442679  hitchhiker  0.000900174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0079  tRNA-Val  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0663805  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0084  tRNA-Val  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0193203  normal  0.0545316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0010  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0060  tRNA-Val  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0041  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297349  decreased coverage  0.00434413 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0061  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.677288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0047  tRNA-Val  95.12 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0087743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0111  tRNA-Val  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0068  tRNA-Val  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0104216  hitchhiker  0.000843897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0081  tRNA-Val  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183039  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0109  tRNA-Val  90.57 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124836  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  97.22 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  97.22 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  97.22 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0040  tRNA-Ala  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000050813  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0062  tRNA-Val  97.22 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  97.22 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0039  tRNA-Ala  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0046  tRNA-Val  97.22 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t55  tRNA-Val  88.14 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1888  tRNA-Val  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1133  tRNA-Val  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>