299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_R0044 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_R0044  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0051  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000163002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  95.38 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  95.38 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  95.38 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  95.38 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  95.38 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  95.38 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  93.85 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  93.85 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  93.85 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  93.85 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  93.85 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-2  tRNA-Val  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.516841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309382  tRNA-Val  92.31 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.658487  normal  0.0584078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0015  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14034  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0014  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0046  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467185  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  92.31 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0014  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309269  tRNA-Val  92.31 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0018  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0043  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0177605  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0040  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288253  hitchhiker  0.000507453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0047  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00873766  hitchhiker  0.00896999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0033  tRNA-Val  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000112986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0016  tRNA-Val  96.08 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000321371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0052    94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0049  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0020  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0025  tRNA-Val  97.83 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368107  normal  0.0217616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA13  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00601929  normal  0.184013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0062  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0056  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0046  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0046  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  90.77 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0043  tRNA-Val  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172535  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0021  tRNA-Val  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0036  tRNA-Val  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0068  tRNA-Val  95.83 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.064456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0054  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0038  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0036  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.012717  normal  0.28653 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11940  tRNA-Val  97.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000016484  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0027  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.480715 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t15  tRNA-Val  92.59 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt01  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4574  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0200099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0029  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.23403e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0031  tRNA-Val  91.38 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0058  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0008  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0045  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.374674 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0953  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0048  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0187429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0039  tRNA-Val  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.910644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0041  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0044  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.306747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0073  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0043  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0024  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.415553  normal  0.401158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0050  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0039  tRNA-Val  89.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00107403  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0105  tRNA-Val  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  89.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  89.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0013  tRNA-Val  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  93.88 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  93.88 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  93.88 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0040  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0014  tRNA-Val  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>