38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_R0017 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_R0017  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0004  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0017  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225526  normal  0.0844719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0044  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.306747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0043  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4574  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0200099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0045  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.374674 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0073  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt01  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0001  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000207511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0039  tRNA-Val  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.910644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0048  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0187429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0611  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0857734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0062  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0001  tRNA-Val  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.709613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0014  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.629466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0002  tRNA-Val  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884588  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0046  tRNA-Val  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0019  tRNA-Val  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0028  tRNA-Val  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.163089  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0046  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0001  tRNA-Val  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4309  tRNA-Val  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0025  tRNA-Val  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.19601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0034  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0146998  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0029  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.76241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0063  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00355332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0035  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>