51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_tRNALysVIMSS1309168 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_tRNALysVIMSS1309127  tRNA-Lys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALysVIMSS1309093  tRNA-Lys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0018  tRNA-Lys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0038  tRNA-Lys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALysVIMSS1309168  tRNA-Lys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148138  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALysVIMSS1309193  tRNA-Lys  98.61 
 
 
72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.238079  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0009  tRNA-Lys  98.61 
 
 
72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0025  tRNA-Lys  98.61 
 
 
72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.810895  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALysVIMSS1309373  tRNA-Lys  98.61 
 
 
72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.589902  normal  0.683475 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALysVIMSS1309293  tRNA-Lys  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.180997 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05871  hypothetical protein  100 
 
 
432 bp  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.791766  normal  0.721442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  91.67 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0046  tRNA-Lys  90.28 
 
 
72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0005  tRNA-Lys  90.28 
 
 
72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0047  tRNA-Lys  90.28 
 
 
72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0672814  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0030  tRNA-Lys  87.5 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.49638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0021  tRNA-Lys  88.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  97.06 
 
 
75 bp  60  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  97.06 
 
 
75 bp  60  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  97.06 
 
 
75 bp  60  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  92.5 
 
 
155 bp  56  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0002  tRNA-Lys  91.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  92.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0074  tRNA-Met  92.31 
 
 
75 bp  54  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565222  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0009  tRNA-Lys  84.93 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  86.79 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0043  tRNA-Lys  90 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00459429  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0003  tRNA-Lys  85.29 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000250623  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt011  tRNA-Lys  87.27 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0172063  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt06  tRNA-Lys  87.27 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000258702  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0071  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0021  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.552016 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0014  tRNA-Lys  93.33 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0079807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  86 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0038  tRNA-Asn  87.04 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.63633e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>