62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_tRNALysVIMSS1309293 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_tRNALysVIMSS1309293  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.180997 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALysVIMSS1309168  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148138  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALysVIMSS1309127  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALysVIMSS1309093  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0038  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0018  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALysVIMSS1309193  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.238079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0047  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0672814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0009  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0005  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0025  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.810895  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALysVIMSS1309373  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.589902  normal  0.683475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0046  tRNA-Lys  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0030  tRNA-Lys  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.49638 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05871  hypothetical protein  92.86 
 
 		 432 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.791766  normal  0.721442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0043  tRNA-Lys  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00459429  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0023  tRNA-Lys  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0048  tRNA-Lys  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.818398 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0019  tRNA-Lys  87.3 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.61246e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0018  tRNA-Lys  87.3 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.50415e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0023  tRNA-Lys  85 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000728017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0024  tRNA-Lys  85 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000367183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0025  tRNA-Lys  85 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000379634  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0006  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303657  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1454  tRNA-Asn  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2542  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2330  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5671  tRNA-Asx  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0524  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4385300000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5148  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  normal  0.479478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4777  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213851  hitchhiker  0.0000000000000219436 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5706  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000905345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0600  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000379275  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0077  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000930167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0033  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>