164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_R0013 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 75 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 75 bp  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0013  tRNA-Asn  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00234115  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0017  tRNA-Asn  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0070  tRNA-Asn  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.213378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0018  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0030  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.28172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5053  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000166826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5647  tRNA-Asx  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5656  tRNA-Asx  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5705  tRNA-Asx  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5713  tRNA-Asx  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.423008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0717839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00125687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000687099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0796  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 153 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.41258e-33 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000262097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.449639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0291  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000965695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0167  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0188  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 153 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0231  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5650  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5663  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4984  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5800  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00845439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5743  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14025  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0033  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000091972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0074  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0111  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00999623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0120  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0269  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5015  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0225437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0042  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000134576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0115  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0124  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 153 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000215336  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2505  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2771  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2780  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0095  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2211  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2458  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2466  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0042  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0016  tRNA-Asn  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000166672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>