66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_14025 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_14025  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2466  tRNA-Asn  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2211  tRNA-Asn  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0095  tRNA-Asn  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2780  tRNA-Asn  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2505  tRNA-Asn  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0073  tRNA-Asn  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0022  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  85.07 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0023  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0043  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122965  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0042  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000336952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0041  tRNA-Met  85.25 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000311146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2458  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0021  tRNA-OTHER  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0370611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2771  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0040  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0042  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0070  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.213378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0017  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0042  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0055  tRNA-Met  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0021  tRNA-Asn  84.13 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0040  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0924427  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0039  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0056  tRNA-Asn  84.51 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0054  tRNA-Asn  84.51 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00592499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0030  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0010  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000288959  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0010  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948194  hitchhiker  0.0000000000358204 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_722  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0018  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.340441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0023  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.299591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.489322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>