69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_R0030 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  94.03 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  92.54 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  91.78 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  91.78 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14025  tRNA-Asn  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0040  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0042  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  94.64 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  91.04 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  91.04 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0040  tRNA-Asn  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0924427  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0018  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.340441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0017  tRNA-Asn  86.57 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.808131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0018  tRNA-Asn  86.57 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0022  tRNA-Asn  87.1 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0033  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000143067  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0042  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0021  tRNA-Asn  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0070  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.213378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0017  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0018  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0030  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.28172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0037  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0056  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0030  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0021  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1182  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.618909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0019  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0014  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355539  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0056  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0010  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0007  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000145435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0056  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0016  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000166672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0011  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00974618  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0024  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000359356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>