49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_R0014 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_R0014  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355539  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0005  tRNA-Asn  96 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.657067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0003  tRNA-Asn  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.401979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  97.62 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0004  tRNA-Asn  97.62 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.392598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0042  tRNA-Asn  97.62 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0049  tRNA-Asn  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0762286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0048  tRNA-Asn  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0021  tRNA-Asn  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.552016 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0025  tRNA-Asn  97.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.452257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  97.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0025  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0024  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0011  tRNA-Arg  85.94 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt02  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0167081 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0056  tRNA-Asn  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0032  tRNA-Asn  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25038  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0014  tRNA-Asn  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.032449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0017  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.674136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07709  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0523717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  86 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>