92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0019 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_R0021  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0019  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0042  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0057  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000258126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0084  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000101082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0056  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0010  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0032  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0052  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.274445  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2771  tRNA-Asn  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2466  tRNA-Asn  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2458  tRNA-Asn  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2211  tRNA-Asn  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0095  tRNA-Asn  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2780  tRNA-Asn  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2505  tRNA-Asn  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0073  tRNA-Asn  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0033  tRNA-Asn  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000143067  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0018  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0030  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.28172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0043  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0017  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0033  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0040  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0924427  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0018  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.340441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0021  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00000256576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0053  tRNA-Asn  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0280094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0018  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0017  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.808131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0040  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0042  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699754 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 155 bp  48.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  83.82 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt02  tRNA-Asn  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00232285  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0013  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00234115  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0009  tRNA-Met  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.349151  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0042  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0703  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0007  tRNA-Asn  82.86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>