71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_R0029 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  97.26 
 
 
76 bp  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  95.89 
 
 
73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14025  tRNA-Asn  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  94.83 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  92.42 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  94.83 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  94.83 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  90.91 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0033  tRNA-Asn  94.23 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000143067  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  89.55 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  89.04 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  87.67 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  88.06 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  91.38 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0042  tRNA-Asn  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0040  tRNA-Asn  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  95.12 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0037  tRNA-Asn  89.29 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  91.07 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0040  tRNA-Asn  89.29 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0924427  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0021  tRNA-Asn  86.57 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00000256576  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  92.16 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0022  tRNA-Asn  92.68 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0018  tRNA-Asn  87.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.340441  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0030  tRNA-Asn  94.29 
 
 
73 bp  54  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  89.09 
 
 
75 bp  54  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  94.29 
 
 
73 bp  54  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  89.09 
 
 
75 bp  54  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  94.29 
 
 
73 bp  54  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0042  tRNA-Asn  94.12 
 
 
73 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  90.24 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0018  tRNA-Asn  85.96 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857849  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0017  tRNA-Asn  85.96 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.808131  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0567  tRNA-Asn  86.79 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0021  tRNA-Asn  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0019  tRNA-Asn  91.89 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0021  tRNA-Asn  91.89 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0017  tRNA-Thr  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0043  tRNA-Asn  86.79 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0003  tRNA-Asn  85.25 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.401979  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0005  tRNA-Asn  85.25 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.657067  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0070  tRNA-Asn  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.213378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0017  tRNA-Asn  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360028  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0055  tRNA-Met  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  87.27 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0056  tRNA-Lys  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0042  tRNA-Asn  83.58 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  83.58 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0558  tRNA-Lys  84.48 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1454  tRNA-Asn  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0064  tRNA-Lys  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  91.18 
 
 
1971 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0653  tRNA-Lys  84.48 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2173  tRNA-Lys  84.48 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.206805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>