83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0010 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0010  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0056  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  96.3 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  96.3 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0032  tRNA-Asn  94.55 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0052  tRNA-Asn  94.55 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.274445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0057  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000258126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0084  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000101082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0042  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0021  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0019  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0095  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2466  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2211  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2780  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2505  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0073  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2458  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2771  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0040  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0924427  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0033  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0017  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0018  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0030  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.28172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0013  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00234115  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0040  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0042  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0042  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0021  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0018  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.340441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0022  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0017  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.808131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0018  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0037  tRNA-Lys  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0036  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0060  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260186  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0011  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0034  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0050  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0595881  unclonable  6.505860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0955  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0134122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0044  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0169442  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0025  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00179903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0001  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.432405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1404  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000898104 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0002  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.823848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0023  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.909867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  86 
 
 		 155 bp  44.1  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>