152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflt02 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mflt02  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00232285  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0703  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0012  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0013  tRNA-Lys  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0042  tRNA-Asn  90.91 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  89.66 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  89.66 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  89.66 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  89.66 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  89.8 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  97.3 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  97.3 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  97.3 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  97.3 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0047  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479856  normal  0.63722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0048  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.645355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0049  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.666985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0050  tRNA-Asn  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  87.27 
 
 
76 bp  54  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  100 
 
 
155 bp  54  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  89.36 
 
 
75 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  89.36 
 
 
75 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0056  tRNA-Asn  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  89.8 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.168441 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  89.8 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0076  tRNA-Asn  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0048  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.929187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.317875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  89.8 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0003  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194068  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0050  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0048  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155621  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0040  tRNA-Met  91.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000293258  hitchhiker  0.00175254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.424478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0031  tRNA-Asn  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0885898  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0042  tRNA-Asn  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0890141  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0029  tRNA-Met  91.67 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  92.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  92.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0057  tRNA-Asn  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000258126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  92.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  92.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0084  tRNA-Asn  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000101082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  91.67 
 
 
1971 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0042  tRNA-Asn  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0072  tRNA-Met  85.45 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.916606  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0027  tRNA-Asn  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000466235  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0041  tRNA-Asn  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000273116  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0028  tRNA-Asn  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015847  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0043  tRNA-Asn  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00393457  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  92.31 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0891  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0019  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000545792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0045  tRNA-Asn  85.45 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.112138  normal  0.31939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0014  tRNA-Met  85.45 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0720319  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0040  tRNA-Asn  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0924427  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0005  tRNA-Asn  85.45 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0013  tRNA-Met  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0042  tRNA-Asn  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699754 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  92.31 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0032  tRNA-Asn  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0052  tRNA-Asn  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.274445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  94.29 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0034  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna54  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>