37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_R0030 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_R0030  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0022  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0042  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0040  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0040  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0924427  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0018  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.340441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0042  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0018  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0017  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.808131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0021  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0048  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14025  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0017  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0028  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.730182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0030  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.28172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0018  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0064  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0056  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  91.18 
 
 		 1971 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0028  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0042  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>