59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0028 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0028  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.730182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0028  tRNA-Trp  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0042  tRNA-Trp  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0009  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0008  tRNA-Trp  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0008  tRNA-Trp  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0009  tRNA-Trp  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31538  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0016  tRNA-Trp  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0019  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03610  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0012  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0071  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0051  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0052  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0052  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0050  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14008  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.030718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0009  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.66226  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0007  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0078  tRNA-Trp  85.92 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0022  tRNA-Trp  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.362458  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0017  tRNA-Trp  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0046  tRNA-Trp  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000756856  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0038  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000191641  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0031  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0018  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0011  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.998721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0047  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.512574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna7  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0034  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0532216  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  100 
 
 		 1431 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t35  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0009  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000520424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0018  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.341765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0419796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0015  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00419833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0024  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1869  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000841204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0051  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0051  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0320  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000012562  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_BR0011  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000243193  normal  0.203474 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0030  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0017  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.735607  decreased coverage  0.0025473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0018  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  decreased coverage  0.00256285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0056  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0054  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194345 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2129  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29900  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2419  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17320  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0043  tRNA-Trp  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0048  tRNA-Trp  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>