114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0078 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0078  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03610  tRNA-Trp  91.89 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0042  tRNA-Trp  90.14 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0028  tRNA-Trp  90.14 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0009  tRNA-Trp  89.19 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0009  tRNA-Trp  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0033  tRNA-Trp  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.076955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0008  tRNA-Trp  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0008  tRNA-Trp  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0056  tRNA-Trp  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0589076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0022  tRNA-Trp  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.362458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0016  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0050  tRNA-Trp  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000112052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  91.53 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0051  tRNA-Trp  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0018  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.341765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0012  tRNA-Trp  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0024  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0052  tRNA-Trp  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0050  tRNA-Trp  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14008  tRNA-Trp  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.030718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0052  tRNA-Trp  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0051  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0051  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551326  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0047  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.512574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna7  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0018  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0034  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0532216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0071  tRNA-Trp  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0019  tRNA-Trp  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t013  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0031  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0032  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.648314  normal  0.932016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0030  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.327508  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0107  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000447975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0113  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0101  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.0160972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0106  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.375874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0121  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000153016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0130  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.108428  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t097  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000384434  normal  0.0126807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0048  tRNA-Trp  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330801  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0017  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.735607  decreased coverage  0.0025473 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0007  tRNA-Trp  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385083  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0009  tRNA-Trp  90.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000520424  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0056  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0015  tRNA-Trp  90.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00419833  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_BR0011  tRNA-Trp  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000243193  normal  0.203474 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1869  tRNA-Trp  90.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000841204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0320  tRNA-Trp  90.74 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000012562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29900  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0043  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0054  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194345 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17320  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0018  tRNA-Trp  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  decreased coverage  0.00256285 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0011  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.998721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0007  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0064  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.829454  normal  0.0150036 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0007  tRNA-Trp  88.33 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00017287  hitchhiker  0.00000137659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0312  tRNA-Trp  88.33 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.21039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t11  tRNA-Trp  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000011334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0005  tRNA-Trp  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0018  tRNA-Trp  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000669798  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0028  tRNA-Trp  85.92 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.730182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0021  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0017  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08690  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000355239  hitchhiker  0.00161168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0066  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0823  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0144883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0046  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60050  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0045  tRNA-Trp  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000437445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0045  tRNA-Trp  84.42 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0046  tRNA-Trp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.590376 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0003  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0018  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  0.24905 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0065  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000631385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0023  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0019  tRNA-Trp  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.77581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0033  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0050  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0017  tRNA-Trp  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000589441  hitchhiker  0.00131035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0013  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000123102  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0046  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0021  tRNA-Trp  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0013  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.799114  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0068  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.423507  normal  0.417359 
 
 
-
 
NC_006368  lppt07  tRNA-Trp  87.04 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt07  tRNA-Trp  87.04 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R86  tRNA-Trp  87.04 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0017  tRNA-Trp  87.04 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225393  normal  0.0224677 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>