7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0041 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_002950  PGt12  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0028  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.730182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>