38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 86 bp  97.6  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0027  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00487683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0024  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0031  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0002  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0047  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t021  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0033  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0352979  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0039  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  hitchhiker  0.00010396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0040  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000655039  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000226044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0038  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00110731  hitchhiker  0.0000326076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0035  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0105  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000142403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t016  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000211867  unclonable  0.00000000000316935 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0003  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.425813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>