47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_R0036 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0052  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2501  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  86.79 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0032  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.269266 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0067  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50283  hitchhiker  0.00109765 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>